曹 阳，男，四川大学生命科学院讲师。2011入四川大学生命科学学院工作。

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性别

男

毕业院校

中国科学院生物物理研究所

职务

四川大学生命科学院讲师

研究领域

生物物理学、生物信息学

人物经历

曹 阳：研究领域为生物物理学，生物信息学，主要从事大分子模拟领域的算法开发与应用，肿瘤相关蛋白质的相互作用预测与分析，药物分子设计。

2000.09～2004.07 西南交通大学应用物理系，获学士学位。

2004.09～2010.12 中国科学院生物物理研究所，获博士学位。

2011入四川大学生命科学学院工作。

研究方向

生物物理学，生物信息学，主要从事大分子模拟领域的算法开发与应用，肿瘤相关蛋白质的相互作用预测与分析，药物分子设计。

主要贡献

学术成果

1.首次提出了基于碰撞回避的自适应迭代算法，编写了蛋白质侧链结构模拟软件CISRR，在同类软件中精度领先。

2.研究发展了一套具有原创性的评分算法HARBP, 预测流感HA蛋白与受体的相互作用，结果通过实验印证，发现了两个影响流感病毒宿主特异性的关键位点。

3.参与发展了一套以结构模板为基础的蛋白质三维结构预测计算软件平台，在2010年国际蛋白质结构预测比赛中，取得了历届国内参赛小组的最好成绩(实验室排名第9，服务器排名第19）。

发表论文

1. Improved side-chain modeling by coupling clash-detection guided iterative search with rotamer relaxation. Bioinformatics 27(6):785-790, 2011。

2. Rapid Estimation of Binding Activity of Influenza Virus Hemagglutinin to Human and Avian Receptors. PLoS One 6(4):e18664, 2011。

3. Incorporation of local structural preference potential improves fold recognition. PLoS One 6(2):e17215, 2011。

4.Structural analysis of alkaline β-Mannanase from alkaliphilic Bacillus sp. N16-5: implications for adaptation to alkaline conditions. PLoS One 6(1):e14608, 2011。

5. Networks of genomic co-occurrence capture characteristics of human influenza A (H3N2) evolution. Genome Research 18(1): 178–187, 2008。